News
Hướng nghiên cứu mới trong chẩn đoán ung thư: Hệ vi khuẩn đường ruột có thể giúp phát hiện ung thư đại trực tràng
Th9
Ung thư đại tràng là nguyên nhân phổ biến thứ hai gây tử vong do ung thư và nguy cơ mắc bệnh trung bình trong suốt cuộc đời của một người là khoảng 1/25.
Nhiều nghiên cứu đã chỉ ra hệ vi khuẩn đường ruột chịu ảnh hưởng rất lớn từ môi trường và thành phần của nó có thể liên quan đến một loạt các bệnh và rối loạn. Do đó, nghiên cứu về cộng đồng vi khuẩn đường ruột có thể mở ra một phương pháp chẩn đoán mới.
Một nghiên cứu mới của Matija Tričković (Đại học Geneva, Thụy Sĩ) sử dụng dữ liệu từ HumGut với hơn 300,000 bộ gen vi sinh vật đường ruột để xây dựng các mô hình phát hiện ung thư đại tràng. Nghiên cứu tập trung vào mức độ phân loài của vi khuẩn nhờ vào tính cụ thể và có thể phân biệt cách thức hoạt động của vi khuẩn góp phần gây ra bệnh, bao gồm cả ung thư. Kết quả nghiên cứu phát hiện được 90% các trường hợp ung thư, so với 94% đạt được bằng phương pháp nội soi đại tràng và tốt hơn tất cả các phương pháp phát hiện không xâm lấn khác. Kết quả đóng góp quan trọng trong việc nghiên cứu các phương pháp tương tự có thể sử dụng để phát triển các công cụ chẩn đoán không xâm lấn cho nhiều loại bệnh dựa trên hệ vi sinh.
Các công trình nghiên cứu về hệ gen vi sinh vật yêu cầu thiết kế thí nghiệm một cách tối ưu và chính xác, QIAGEN tự hào là một trong các đơn vị cung cấp giải pháp toàn diện, hỗ trợ và đồng hành cùng các nghiên cứu từ xử lý mẫu đến phân tích kết quả.
Số liệu tham khảo từ QIAGEN cho thấy kết quả được cải thiện khi sử dụng bộ kit tách chiết tối ưu:
Kết quả phân tích định danh loài và phân tích độ phong phú đa dạng hơn khi sử dụng QIAamp DNA Host-Free Microbiome Kit cho khối u ruột kết và mô khỏe mạnh.
Giải trình tự DNA được thực hiện bằng bộ kit QIAseq FX DNA Library UDI-A (96) trên máy NextSeq 2000, Illumina kết hợp với NextSeq™1000/2000 P1 Reagent (600 chu kỳ). Dữ liệu phân loại được gán với Cơ sở dữ liệu UHGG (Unified Human Gastrointestinal Genome) sử dụng QIAGEN CLC Genomics Workbench và CLC Microbial Genomics Module.
Nguồn trích dẫn:
- Gut bacteria can reveal colorectal cancer – University of Geneva, Switzerland
- Tričković, Matija, et al. “Subspecies of the human gut microbiota carry implicit information for in-depth microbiome research.” Cell Host & Microbe 33.8 (2025): 1446-1458.
- Hiseni, Pranvera, et al. “HumGut: a comprehensive human gut prokaryotic genomes collection filtered by metagenome data.” Microbiome 9.1 (2021): 165.
- https://www.qiagen.com/us/applications/microbiome/human-biomedical-research
- https://www.qiagen.com/us/products/discovery-and-translational-research/dna-rna-purification/dna-purification/microbial-dna/qiaamp-dna-host-free-microbiome?catno=51904
